Résumé : By looking at the common thread between 4 programs* in which the IFREMER Palavas (34, Languedoc-Roussillon region in France) station took part, this report show the evolution over 20 years in the perception of the pathology of farmed fish, and of the sea bass in particular (Dicentrarchus labrax). During the 1990’s farming techniques became sufficiently reliable to enable to distinguish between problems of a zootechnical nature and those with a pathological origin. In anticipation of future illnesses, the necessary tools and monitoring were implemented in order to study the immune system of the sea bass. These methods arose from the recent creation of anti-immunoglobin monoclonal probes in the sea bass. These techniques, together with others, served to search for a solution to the nodavirus epidemic which struck in1996. In the absence of a cure for this virus, the research focused on knowledge of the virus, its epidemiology and vaccine development. Despite interesting scientific results, the solution withheld to curb the Nodavirus epidemic was zootechnical. This pragmatic outcome catalysed reflections on the role of pathology, leading to notions of health, animal well-being and image. Management choices in the health of farmed fish stocks became a parameter, amongst others, included in a global commercial and farming policy. * Définition des critères d’évaluation de l’immunocompétente chez le loup et le turbot. UMR1 Université Montpellier II IFREMER ; Nodavirus disease of cultured marine fish in Europe. FAIR PL98 4036 EU; Recherche de moyens de dépistage et prévention de la nodavirose du bar. ANVAR 9804041J ; Welfare and Health in Sustainable Aquaculture WEALTH. E.U N°501984.
En prenant comme fil conducteur les travaux de 4 programmes* auxquels a participé la station IFREMER de Palavas (34), ce rapport montre l’évolution sur 20 ans de la perception de la pathologie des poissons d’élevages et du loup en particulier (Dicentrarchus labrax). Dans les années 1990 les techniques d’élevages devinrent suffisamment fiables pour permettre de distinguer les problèmes d’origines zootechniques de ceux d’origines pathologiques. En prévision des futures maladies potentielles, les outils d’étude et de suivi du système immunitaire spécifique du loup furent mis en place. Ils découlaient de la création récente de sondes monoclonales anti-immunoglobulines de loup. Ces techniques, couplées à d’autres, servirent à chercher une solution à l’épidémie de nodavirose des années 1996. En l’absence de traitement pour un virus l’accent fut mis sur la connaissance du virus, de son épidémiologie et de la vaccination. Bien que les résultats scientifiques furent très satisfaisants la solution trouvée pour juguler l’épidémie de Nodavirose fut zootechnique. Cette issue pragmatique catalysa une réflexion sur le rôle de la pathologie qui maturait depuis plusieurs années et qui déboucha sur la notion de santé, de bien être des animaux et d’image. Les choix de gestion de la santé des cheptels devinrent un paramètre, parmi d’autres, s’incluant dans d’une politique globale d’élevage et commerciale * Définition des critères d’évaluation de l’immunocompétente chez le loup et le turbot. UMR1 Université Montpellier II IFREMER ; Nodavirus disease of cultured marine fish in Europe. FAIR PL98 4036 EU; Recherche de moyens de dépistage et prévention de la nodavirose du bar. ANVAR 9804041J ; Welfare and Health in Sustainable Aquaculture WEALTH. E.U N°501984.

Droits : 2013 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00167/27866/26103.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00167/27866/26105.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00167/27866/26106.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00167/27866/

Éditeur(s) : PSIC 11 - 11th Pacific Science Inter-Congress : Pacific Countries and their Ocean: Facing Local and Global Changes / 2nd Symposium on French Research in the Pacific. March 2 - 6, 2009 Tahiti, French Polynesia.
Résumé : Experimental infections together with epidemiological studies have shown that pathogenic and non‐pathogenic isolates of V. nigripulchritudo co‐existed in shrimp farm environment (2, 3). Moreover, obtained results also demonstrated that the “summer syndrome”was caused by a single, possibly emerging, cluster of virulent strains. Consequently, it was hypothesized that pathogenic strains of V. nigripulchritudo may persist from one year to the next in the shrimp farm environment and re‐develop inside the grow‐out system at the following rearing cycle (3). This study was therefore aimed at determining whether V. nigripulchritudo isolates may survive, or not, in a shrimp pond bottom soil during a 18‐week drying period. To this end, V.nigripulchritudo mapping was performed with recently developed molecular tools and classical culture‐dependent techniques.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/00197/30874/29242.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00197/30874/

Éditeur(s) : HAL CCSD Public Library of Science
Résumé : International audience
Among persisting questions on bone calcification, a major one is the link between protein expression and mineral deposition. A cell culture system is here proposed opening new integrative studies on biomineralization, improving our knowledge on the role played by non-collagenous proteins in bone. This experimental in vitro model consisted in human primary osteoblasts cultured for 60 days at the surface of a 3D collagen scaffold mimicking an osteoid matrix. Various techniques were used to analyze the results at the cellular and molecular level (adhesion and viability tests, histology and electron microscopy, RT-and qPCR) and to characterize the mineral phase (histological staining, EDX, ATG, SAED and RMN). On long term cultures human bone cells seeded on the osteoid-like matrix displayed a clear osteoblast phenotype as revealed by the osteoblast-like morphology, expression of specific protein such as alkaline phosphatase and expression of eight genes classically considered as osteoblast markers, including BGLAP, COL1A1, and BMP2. Von Kossa and alizarine red allowed us to identify divalent calcium ions at the surface of the matrix, EDX revealed the correct Ca/P ratio, and SAED showed the apatite crystal diffraction pattern. In addition RMN led to the conclusion that contaminant phases were absent and that the hydration state of the mineral was similar to fresh bone. A temporal correlation was established between quantified gene expression of DMP1 and IBSP, and the presence of hydroxyapatite, confirming the contribution of these proteins to the mineralization process. In parallel a difference was observed in the expression pattern of SPP1 and BGLAP, which questioned their attributed role in the literature. The present model opens new experimental possibilities to study spatio-temporal relations between bone cells, dense collagen scaffolds, NCPs and hydroxyapatite mineral deposition. It also emphasizes the importance of high collagen density environment in bone cell physiology.
ISSN: 1932-6203

hal-01142641
http://hal.upmc.fr/hal-01142641
http://hal.upmc.fr/hal-01142641/document
http://hal.upmc.fr/hal-01142641/file/Silvent_2013_Collagen.pdf
DOI : 10.1371/journal.pone.0057344

Résumé : This book represents a two year study by a team of French biologists to collect, summarise and present the experience and knowledge gained in the rearing of the giant freshwater prawn, not only in the French overseas territories but also in the main countries which are developing this culture. This document comprises four parts : - The first describes the world market. The prawn rearing is already an economic reality in the tropical world, the United States and in Europe. - The second on shows that, although the culture techniques are quite complex, production systems can be adapted to local conditions and markets. - The third part is a practical guide, both for investors and farmers, giving all necessary data to start-up and monitor a project in the best conditions. - The final part summarises the main elements of the biology of this species, in order that people interested in its development may have a better understanding of its life history. The authors were based at the aquaculture laboratory of the Ifremer station of French Guiana from 1989 to 1990 and had 15 years previous experience of this culture in Tahiti and the Caribbean. Regarding this initial complete French synthesis on this species in a special care has been given to balance accurate scientific reporting with the objective of reaching a wider audience.
Quinze années d'expérience sur l'élevage de la crevette d'eau douce tropicale, à Tahiti, aux Antilles et en Guyane, comme dans les principaux pays qui pratiquent cet élevage, sont rassemblées et synthétisées dans cet ouvrage. - Où en est le marché mondial ? Cet élevage est déjà une réalité économique dans le monde tropical, comme sur les marchés américain ou européen. - L'exploitation du cheptel est complexe, mais des schémas de production peuvent être adaptés aux conditions locales d'élevage et de marché. - Ce guide pratique donne toutes les informations nécessaires pour monter un projet et le mettre en oeuvre dans de bonnes conditions. - Pour élever la crevette, il faut mieux la connaître. On trouve ici les éléments essentiels de la biologie de cette espèce. L'ouvrage a été rédigé par l'équipe du laboratoire d'aquaculture de la station Ifremer de Guyane en 1989 et 1990. Ce guide, première synthèse en langue française, est unique en son genre. Il équilibre rigueur scientifique et esprit de vulgarisation pour s'adresser aussi bien aux scientifiques et techniciens qu'aux éleveurs ou aux décideurs du développement.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1991/rapport-639.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/639/

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
The Environmental Relative Moldiness Index (ERMI) is a DNA-based metric developed to describe the fungal contamination in US dwellings. Our goal was to determine if the ERMI values in dwellings in north western France were correlated with other measures of fungal contamination. Dust and air samples were obtained from 40 dwellings and analyzed by quantitative PCR and/or by culturing. These dwellings were also inspected and the amount of visible fungal growth estimated in m(2). The ERMI values in these dwellings ranged from -2.7 to 28.8 and the fungal contamination estimates ranged from 0 to 20 m(2). The 40 dwellings were divided into those with a low (<6) or high (>8) ERMI values (n=20 in each). The average ERMI value was 15.70 for the high ERMI compared to 2.68 for the low ERMI dwellings. ERMI values were correlated (significant Kendall's tau values) with concentrations of fungi in air samples analyzed by QPCR or culturing. ERMI values were also correlated (significant Kendall's tau values) with the visible estimates of fungal contamination. Older dwellings were more likely to have higher ERMI values. These results suggest that the ERMI dust sample, which is quick and easy to collect, may be useful in making decisions about reducing fungal exposures in homes.
ISSN: 0048-9697

hal-00874733
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00874733
DOI : 10.1016/j.scitotenv.2012.08.085
PUBMED : 23022719

Résumé : This report includes a qualitative and descriptive approach of the oyster and mussel industries in the European Community. This report compares the structure of production, the marketsn the professional organisation, competition for the resource, legislation and support systemat the community levell. Technical and statistical datas are summarized to représent the structure of the industry, the trade flows and the main evolutions of the two industries in the EC. A summary of the county reports gives an overview of the present state of the industry in each country and suggest a first evaluation of constraints and prospects. [NOT CONTROLLDED OCR]
Ce rapport comprend une approche descriptive et qualitative du secteur conchylicole traditionnel (moules et huîtres) dans la Communauté Européenne. Il aborde les aspects production, marché, organisation, réglementation, système d'aide dans les différents pays par une analyse comparative des secteurs, complétée par une synthèse chiffrée des données techniques et statistiques. Une vision d'ensemble des flux et de l'évolution des deux filières dans la Communauté est ainsi présentée. Un résumé des rapports nationaux évalue l'organisation, les contraintes et les perspectives du secteur dans chacun des pays. [OCR NON CONTRÔLE]

Droits : 1993 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/1993/rapport-4176.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/1993/sup-4176.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/4176/

Résumé : Marine capture fisheries in Jamaica is primarily artisanal in nature ansd is conducted maiinly by fishermen operating from canoes. Approximately 95% of these fishermen operate on the coastal shelf and its associated banks. The commercial species harvested comprise bottom-dwelling, coral reef species and free swimming species of finfish. Other fishery resources of commercial value include marine shrimp, conch and lobsters. Catch statistics are not available for all species, but the Department of Fisheries reports a slight decline in fishery production with production decreasing from 16 milion lbs in 1990, despite the fact that fishing efforts have doubled. Over this period the number of registered fishermen has grown from 12 000 to 16 000, al of whom are engaged in full-time fishing. There arealso part-time fishermen who are not registered. The decline in fish catch is accompanied by a decrease in fish size and quality, suggesting that the fisheries are under pressure and have already exceeded optimum production in relation to vailable resources. As a result the economic returns to fishermen are declining. There are also other problems, such as high incidence of conflicts among fishermen at sea, the high cost of purchasing boats, outboard engine fuel, and equipment, with together with the dangers involved in fishing offshore (piracy, and praedial larceny) create serious social ans economic difficulties for fishermen. Notwithstanding, there is an apparent move on the part of the fishermen to leave the industryor to seek alternative forms of employment. In fact, the Department ofFisheries reports that it is still reciving applications for new licences to operate fishing boats. This is probably due to the fact that where the basis of a community is fishing, it becomes difficult to introduce alternative forms of employment, such as cottage industries, village crafts and other trades. In 1987 the Jamaica Department of Fisheries prepared a Management plan which proposed several conservation measures to promote the efficient use of fisheries resources and to control the development of the Fishery in such a way that the country would receive highest benefits. Adequate attention was given to limitations on fishing gear, institution of closed seasons and related legislation. Strategies to diversify the marine fishing were also proposed. The 1990 five year Devlopment Plan for marine fisheries also focuses on proper resource management in order to reverse trends associated with the overexploitation of marine resources. According to the plan, emphasis will be placed on inland fisheries and mariculture in order to reduce pressure on the fisheries. Inland fisheries in the form of freshwater fish fanning has expanded significantly over the past 10 years with production increasing from less than 0,5 million lbs. in 1980 to in excess of 6.0 million lbs. in 1989. However, some freshwater fish farmers are already experiencing serious competition for water usage and, to a lesser extent for land from crop-producing farmers. The Ministry of Agriculture is of the view that marine cage culture technologically has the potential for introduction in Jamaica . This technologyhas been successfully developed in Norway and the technology is currentlty being experimentally utilized in several countries in the area. The technology, if widely utilized in Jamaica, couls significantly reduce pressure on fisheries, making fishing more cost effective and improve the economic returns to fishermen. Already there exist some technical and institutional capabilities in Jamaica to support commercial development of marine cage culture. The Department of Fisheries has highly trained personnel in aquaculture and marine fisherie, some of whom are directly responsible for the success of freshwater fish fanning. In adition, the Marine Laboratory at the Univesity of the West Indies (UWI) is caarying research on hatchery facilities for marine cage farming. The Department of Fisheries will seek the collaboration ofg the marine unit at UWI which could provide fingerlings of selected marine species for cage 1
Les pêcheries de captage marin en Jamaïque sont principalement de nature artisanale et elles sont dirigées principalement par les pêcheurs qui travaillent depuis des canoës. Environ 95 % de ces pêcheurs travaillent sur la plaine côtière et ses bancs associés. Les espèces commerciales récoltées comprennent les espèces benthiques, les espèces de corail et les espèces de poisson marin de nage libre. D'autres ressources de pêcheries de valeur commerciale comprennent la crevette, la conque et le homard. Les statistiques des pêches ne sont pas disponibles pour toutes les espèces, mais le Département des Pêcheries fait état d'une légère réduction de production de pêcheries, la production se réduisant de 16 millions de livres en 1990, en dépit du fait que les efforts de la pêche ont doublé. Sur cette période le nombre de pêcheurs inscrits a augmenté de 12 000 à 16 000, dont tous sont occupés à plein temps à la pêche. Il y a aussi des pêcheurs à mi-temps qui ne sont pas inscrits. La réduction des pêches est accompagnée d'une réduction de la taille et la qualité des poissons, ce qui implique que les pêcheries sont sous pression et qu'elles ont déjà dépassé la production optimum par rapport aux ressources disponibles. En conséquence, les rendements pour les pêcheurs sont en baisse. Il y a aussi d'autres problèmes, tels qu'un taux élevé de conflits entre les pêcheurs en mer, le coût élevé pour acheter les bateaux, le combustible pour les moteurs hors-bord, et le matériel, ainsi que les dangers impliqués dans la pêche offshore (le piratage, et le vol prédial) ont créé de graves problèmes sociaux et économiques pour les pêcheurs. Néanmoins, il y a une tendance évidente chez les pêcheurs de quitter l'industrie ou de chercher du travail dans d'autres domaines. En fait, le Département des Pêcheries signale qu'il continue de recevoir des demandes de nouveaux permis pour opérer les bateaux de pêche. Ceci est probablement attribuable au fait que là où la base d'une communauté est la pêche, il est difficile d'y introduire des formes alternatives de travail, telles que l'industrie artisanale, l'artisanat de village ou d'autres métiers. Le Département des Pêcheries de la Jamaïque a préparé en 1987 un Projet de gestion qui proposait plusieurs mesures de conservation afin d'encourager l'utilisation efficace des ressources des pêcheries et de contrôler le développement de la Pêcherie de manière que le pays touche le plus de bénéfices. Une attention adéquate a été prêtée aux limitations sur les engins de la pêche, l'établissement de saisons de clôture et les législations associées. Des stratégies pour diversifier la pêche marine ont aussi été proposées. Le Plan de développement quinquennal de 1990 pour les pêcheries marines met l'accent aussi sur la gestion de ressources appropriée afin de faire reculer les tendances associées à la surexploitation des ressources marines. Selon le plan, l'accent sera mis sur les pêcheries intérieures et la mariculture afin de réduire la pression sur les pêcheries. Les pêcheries intérieures, sous la forme de l'élevage de poissons en eau douce, ont pris leur essor sur les 10 dernières années avec une production qui s'est élevée de moins de 0,5 millions de livres en 1980 pour atteindre en 1989 plus de 6.0 millions de livres. Cependant, certains pisciculteurs en eau douce expérimentent déjà une concurrence sérieuse avec les agriculteurs pour l'usage de l'eau et, dans une moindre mesure, de la terre. Le Ministère de l'Agriculture est de l'avis que l'élevage en cage marine a technologiquement le potentiel d'être introduit en Jamaïque. La technologie a été développée avec réussite en Norvège et plusieurs pays dans la région utilisent actuellement la technologie expérimentalement. La technologie, si elle était utilisée en Jamaïque, pourrait réduire de façon significative la pression sur les pêcheries, ce qui rendrait la pêche plus économique et améliorerait les rendements aux pêcheurs. Certaines capacités techniques et institutionnelles existent déjà en Jamaïque qui pourraient soutenir le développement de l'élevage en cage marine. Le Département des Pêcheries a un personnel bien formé en aquaculture et pêcherie marine, dont certains qui sont directement responsables du succès de la pisciculture en eau douce. Par ailleurs, le Laboratoire Marin à l'Université des Antilles (UWI) mène des recherches sur les installations d'écloseries pour l'élevage en cage marine. Le Département des Pêcheries demandera la collaboration de l'unité marine à l'UWI qui pourra fournir des saumoneaux d'espèces marines sélectionnées pour la cage 1.

Droits : info:eu-repo/semantics/openAccess
http://archimer.ifremer.fr/doc/1993/rapport-1918.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/1918/

Éditeur(s) : Elsevier
Résumé : Because Vibrio aestuarianus is known to cause serious infections in Pacific oyster Crassostrea gigas, a real-time PCR assay was developed targeting the dnaJ gene of this bacterium. Only V. aestuarianus strains isolated from C. gigas mortality events in different geographic areas and the reference strain tested positive, whereas no amplification products was obtained with type strains belonging to 23 other species of Vibrio. Sensitivity and reproducibility of the method were assessed using either seawater or oyster homogenate samples spiked with one V aestuarianus strain. All these samples were stored at -20 degrees C in order to mimic retrospective or grouped natural sample analysis without quantification bias due to prolonged freezing. Analysis of standard curves revealed excellent correlation values between light microscopy cell enumerations and PCR Threshold Cycle (Ct) values, and acceptable PCR reaction efficiencies for all type of samples. Quantification curves of both sample types were equivalent, with a detection level as low as 1.6 V. aestuarianus cells in the PCR reaction tube, corresponding to 1.6.10(2) cells ml(-1) and 1.6.10(2) cells mg(-1) in seawater and entire oyster samples, respectively, taking into account the dilution factor used for appropriate template DNA preparation. Comparison of PCR assay reproducibility according to the complexity of samples revealed that seawater samples gave more reproducible quantification measures than samples from oyster homogenate, with precision of measured Ct values inferior to 0.4 and 0.6 respectively at 99% confidence. Use of the real-time PCR assay allowed us to monitor V. aestuarianus load in oysters naturally infected with this pathogen. Furthermore, we were able to detect V aestuarianus in samples of seawater in which oysters had been reared and in algal cultures used for feeding oysters. Because of the rapidity and reliability of the real-time PCR assay method used in this study, just a few hours are needed compared with the two days required using the classic culture method, this technique will be particularly valuable in mollusc pathology laboratories, for monitoring the source and course of infections by V. aestuarianus in pathogenesis and epidemiologic studies, as well as for designing appropriate prophylactic control measures. (C) 2009 Elsevier B.V. All rights reserved.
Journal of Microbiological Methods (0167-7012) (Elsevier), 2009-05 , Vol. 77 , N. 2 , P. 191-197

Droits : 2009 Elsevier B.V. All rights reserved.
http://archimer.ifremer.fr/doc/2009/publication-6447.pdf
DOI:10.1016/j.mimet.2009.01.021
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/6447/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
Chaque pratique professionnelle, chaque métier a son langage. Le métier d’enseignant n’échappe pas à ce processus de construction d’une sémiotique qui, à la fois, construit une pratique et se trouve inévitablement construite par cette dernière. Les gestes d’un expert pratique ne se réduisent pas aux actions qui les manifestent, ils signifient. Ils représentent la forme discursive et symbolique d’actions et de pouvoir-savoir (Foucault, 1969) au sein d’une pratique culturellement et socialement identifiée. L’expert, par sa pratique, ses gestes de corps, ses dires, contribue à l’ethnohistoire de sa pratique. Comment un enseignant perçoit-il ses actes d’intervention et en particulier son acte de formation? Dans quel univers sémiotique son expérience d’enseignant et/ou de formateur se manifeste-t-elle, se construit-elle ?Nous avons entamé au sein de notre laboratoire, un programme de recherches consacré à la sémiotique des pratiques sportives et des pratiques d’éducation et de formation sur le sens et les significations que donnent, à leurs actes professionnels, les enseignants et les formateurs. Cela nous conduit à prendre en compte la part subjective du sujet dans le processus d’élaboration et de réalisation de ses actes, en employant des méthodes qualitatives utilisant en particulier les techniques vidéo de rappel stimulé (Tochon, FV. 2002) les dispositifs d’auto-confrontation (Clot Y., 2000) et/ou d’explicitation (Vermersch P. ,1994) ou encore d’histoire de vie (Pineau ,G. 1998). Nous avons mis au point un dispositif de formation- recherche plus particulièrement consacré l’ imaginaire des praticiens à propos de leurs actes d’intervention. Il s’appuie sur un outil de stimulation projective, le photolangage, pratiqué dans le cadre d’une problématique de formation publiée par ailleurs (Alin C. , 1996). La recherche porte sur une étude comparée du choix ordonné par ordre décroissant de préférence de cinq photos sur 20 et des jugements discursifs, écrits et argumentatifs, portés rationnellement sur ces choix, à propos de l’acte professionnel : “ former? ”. Nous présentons deux études comparatives du sens et des significations donnés à l’acte “ former ” par des praticiens expérimentés et/ou de futurs praticiens.La première concerne un échantillon représentatif d’experts et de novices en Education Physique et Sportive. Nous avons analysé chacune des photos choisies et chacun des jugements arguemtatifs qui leur étaient affectés, en puisant principalement nos fondements théoriques dans les travaux précurseurs de sémiotique de C.S. Peirce (1979), ceux de la théorie sémiocognitive et expérientielle de Lakoff G. & Johnson M. (1980, 1985), ainsi que dans les travaux d’analytique du langage de Coursil J. (2000), en matière de dialogue et de communication, Sur le plan méthodologique, nous avons travaillé sur les trois registres évoqués dans notre protocole de recherche (sémantique, sémiotique, symbolique) pour établir trois types de documents d’analyse : une carte sémiotique par photos choisies ; trois réseaux sémiotiques (Novices, Experts, Communauté EPS) ; des profils sémiotiques collectifs et individuels. La deuxième étude, actuellement en cours d’analyse, a pour but de comparer, avec le même protocole, des étudiants français de l’Université des Antilles et de la Guyane et des étudiants américains de l’Université de Madison (Wisconsin USA). Elle devrait nous donner quelques indications sur des aspects interculturels quant à la perception imaginaire de l’acte de former par des étudiants de culture différente se destinant à la formation. Sur les plans épistémologique, théorique et méthodologique, nous interrogeons les rapports étroits de sémiotique, de culture et de logique qui lient langage et images, perception et action, langage et action, langage et identité à propos d’un acte professionnel “ former? ” et de l’ethno- histoire d’une pratique.
8ème Congrès de l’Association Internationale de Sémiotique, Université de Lyon 2
Lyon, France

hal-01613692
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01613692

Résumé : Les objectifs de développement de systèmes de culture durables imposent aux acteurs du développement rural une reconception de ces systèmes. Les méthodes de conception actuelles conduisent souvent les chercheurs à être seuls concepteurs alors que parallèlement l'appropriation des innovations dépend fortement de l'implication des autres acteurs. En réponse, des approches participatives sont de plus en plus fréquentes pour pallier à cette difficulté d'appropriation. La méthode développée dans cette thèse -nommée DISCS pour 're-Design and assessment of Innovative Sustainable Cropping Systems' - met en oeuvre un processus de reconception des systèmes de culture par une approche participative tout en développant des outils d'évaluation multicritère. La méthode DISCS s'inscrit dans la lignée de la méthodologie du prototypage mais se différencie par une démarche itérative à trois échelles d'étude (parcelle, exploitation et territoire) afin de s'assurer que les innovations répondent bien aux attentes des acteurs. A chaque étape du processus une évaluation est réalisée à l'aide d'un jeu d'indicateurs. DISCS a été testée sur le système de culture agrumicole en Guadeloupe dans un but de réduire l'utilisation des pesticides. Cinq prototypes de gestion de l'enherbement ont été conçus collectivement puis testés selon les principes d'une approche systémique. Dans cette thèse, nous présentons les premières étapes de reconception du système agrumicole guadeloupéen basée sur la méthode DISCS. Notre travail nous permet de recommander des techniques de gestion de l'enherbement en jeunes vergers d'agrumes répondant aux contraintes actuelles de développement de systèmes de culture durable.
Re-designing sustainable cropping systems has become a major challenge for agricultural researchers and farmers. In most designing methods, researchers are the main, or sometimes the only designers. However, more and more attempts for involving different kinds of stakeholders in participatory approaches have been accounted for. The new method described in this thesis (DISCS for 're-Design and assessment of Innovative Sustainable Cropping Systems') implements a participatory re-designing process. Though founded on the common structure of prototyping methods, this five-step-method differs first by implementing three progress loops, at experimental field, farm then regional scale. Besides, an ongoing progress dynamic is set between research at the experimental station and crop management in farms, in order to ensure that innovative techniques actually match the farmers' expectations. Assessment at each step is performed using a scale-specific set of indicators. The DISCS method was tested on citrus production in Guadeloupe, to develop lower-pesticide sustainable cropping systems. Five weed management prototypes were collectively designed then tested at an experimental station based on the principles of a systematic approach. In this thesis, we present the first stages of citrus cropping system redesigning based on DISCS method. Our work enables us to recommend sustainable weed management techniques for young orchards that correspond to the current constraints facing orchards in Guadeloupe

http://www.theses.fr/2011AGUY0449/document

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
In a period of agricultural decline in the uplands of Europe, agriculture is ceasing to provide the primary rationale for the organisation, utilisation and functioning of rural space. Policy reform, market trends and changes to the way citizens and consumers think about the countryside all suggest a need for thinking strategically about the future development of these areas. However, without a broad involvement of stakeholders, land use conflicts, and social and cultural conflicts in general, may increase. Involving stakeholders in upland areas can be facilitated by using scenario technique and by discussing alternative futures in local stakeholder panels. In this paper we present four scenarios of land-use change for the year 2030, and their assessments by stakeholder panels in Scotland, France, Norway, Switzerland, Slovakia and Greece. The aim of the paper is to explore the ways in which stakeholders in these locations advocate and assess these scenarios. We also explore how stakeholders in different countries weight the visual landscape impacts, the livelihood and biodiversity aspects of the scenarios in their assessment, and the reasons for their prioritising. The cross-country analysis shows that stakeholders across the study areas are united in their overall rejection of agricultural liberalisation, advocating a production-oriented, but multifunctional and environmentally-friendly agriculture that maintains landscapes and biodiversity.
ISSN: 0743-0167

halshs-01227527
https://halshs.archives-ouvertes.fr/halshs-01227527
DOI : 10.1016/j.jrurstud.2007.04.001

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : International audience
After an important methodological presentation of lithic technology analysis, we present in this paper a diachronical study of the martinican Amerindian flint-knapping technology. This work completes the results of ceramics analysis and open new ways of understanding of the prehistorical cultural changes.
L'analyse technologique des industries lithiques a pour objectif la caractérisation des méthodes et des techniques de taille. Elle s'appuie sur la conception de l'acte technique comme un fait culturel à part entière. L'analyse d'un système technique permet alors la caractérisation d'un ensemble culturel et par là même la comparaison de différents ensembles. L'analyse technologique du débitage en particulier s'appuie sur la lecture et l'interprétation des différents stigmates liés à la fracture conchoïdale. Ces stigmates permettent de déterminer, la nature, la direction et la chronologie des enlèvements, et ainsi de réintégrer chaque pièce au sein d'une chaîne opératoire de débitage. C'est ce type d'étude que nous avons conduite en Martinique. Nous avons ainsi pu revoir, à la lumière de l'évolution des méthodes de débitage, la séquence culturelle de cette île. Nous pouvons ainsi mieux appréhender l'importance des changements, mis en évidence par l'étude de la céramique, par la prise en compte d'autres éléments du système technique.
Actes du XVIIIéme congrès de l'Association Internationale d'Archéologie de la Caraïbe, St. George, Grenade 1999
Saint George, Grenada

hal-00966338
https://hal.univ-antilles.fr/hal-00966338
https://hal.univ-antilles.fr/hal-00966338/document
https://hal.univ-antilles.fr/hal-00966338/file/Technologie_lithique_et_caractA_risation_culturelle.pdf

Résumé : La conchyliculture connaît depuis une trentaine d'années une progression régulière de ses productions à travers le monde. Elle représente une activité économique importante avec plus de 240 000 tonnes de coquillage produit annuellement en France. Cependant le développement de cette activité peut être limité par des mortalités parfois massives dues à des maladies infectieuses. L'augmentation des productions peut être expliquée par l'amélioration des méthodes d'élevage grâce à une meilleure connaissance de la biologie des bivalves et des processus physiologiques liés à leur reproduction : l'apparition de l'élevage larvaire en écloserie a permis de pallier le caractère aléatoire et souvent insuffisant du captage naturel. Ces nouvelles techniques ont permis d'acquérir une certaine indépendance vis-à-vis des pontes naturelles, mais ont entraîné une augmentation des transferts d'animaux entre les bassins conchylicoles, une augmentation des densités de mollusques et le développement d'une espèce cible par bassin. Ces actions ont contribué à l'apparition et à la dissémination de nouvelles maladies entraînant de très fortes pertes pour la conchyliculture. De plus, la palourde, comme tous les mollusques marins, présente des caractéristiques biologiques qui laissent peu de possibilités d'actions pour protéger une production vis-à-vis de maladies infectieuses: la culture de ces espèces en milieu ouvert rend tout traitement impossible du fait des quantités de substance à utiliser, et de la forte probabilité de contamination des animaux. Cette méthode peut être appliquée dans le cas d'élevages intensifs : écloseries, nurseries. Le système immunitaire des mollusques est primitif, ils ne possèdent pas de lymphocytes B et lymphocytes T, ce qui empêche toute réponse immune spécifique et rend la vaccination impossible. L'absence d'anticorps spécifique complique la recherche d'agent pathogène, celle-ci n'est possible que par un diagnostic direct, essentiellement réalisé grâce à l'histologie ou à la microscopie.

Droits : 2006 IUT La Rochelle, Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14457/11759.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14457/

Éditeur(s) : HAL CCSD Elsevier
Résumé : International audience
Voltage-gated calcium currents are important for the survival and growth of embryonic cockroach brain neurons in primary culture. In the present experiments, we have studied, using the patch-clamp technique, the evolution with time in culture of the voltage-dependency and of the pharmacological properties of the calcium conductance of these neurons during the formation of a network. We have observed a progressive increase of the high-voltage-activated calcium conductance and a 10mV shift of the voltage-dependency of activation towards more negative potentials. The proportion of the R-like calcium current component increased during network formation. At the same time, the highly omega-AgaTxIVA-sensitive P-like component of the current is progressively replaced by a component which is less sensitive to the toxin. The origin and functional implications of these modifications are discussed.
ISSN: 0304-3940

hal-00982273
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00982273
DOI : 10.1016/j.neulet.2004.05.002
PUBMED : 15246554

Éditeur(s) : ISTPM
Résumé : Les besoin croissants de l'industrie française en carraghénophytes de qualité, jusqu'alors quasi totalement importés, ont conduit à s'intéresser aux possibilités de culture intensive de certaines espèces en bassins à terre, dans un milieu enrichi en sels minéraux. Les résultats convaincants obtenus par la Société CECA (CECA, 1980) sur l'algue rouge d'eaux tempérées Chondrus crispus (70 tonnes de matières sèches/ha/an) ont laissé entrevoir la possibilité d'appliquer ces techniques de culture intensive à d'autres carraghénophytes, dont Eucheuma spinosum, espèce tropicale riche en iota carraghénane. C'est pourquoi, parallèlement aux essais de culture en milieu naturel de cette espèce, réalisés aux Antilles (BARBAROUX et al., 1984), une approche de la culture intensive en bassin d'eau de mer enrichie a été tentée, et ce dans les mêmes sites.
Science et Pêche (0036-8350) (ISTPM), 1984-09 , Vol. 348 , P. 10-20

Droits : Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/1984/publication-7040.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00000/7040/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : National audience
Comme c'est le cas pour toute innovation technique, l'avènement de la Télévision Numérique Terrestre (TNT) en France repose sur un ensemble d'imaginaires technologiques. En effet, l'illusion techniciste se cristallise autour de la croyance collective selon laquelle la technique recélerait des vertus humanistes, à savoir, le progrès, le développement, la démocratie, la réduction des inégalités, la rencontre, l'échange, le partage, etc. La TNT est d'abord une technologie prometteuse qui performe le mode de diffusion hertzienne. Elle permet de diffuser sur un même canal hertzien de six à dix chaînes au lieu d'une seule en analogique. Elle augmente l'offre de programmes (chaînes nationales publiques et privées, chaînes locales publiques et privées) en proposant un bouquet de chaînes gratuites en qualité numérique. Ainsi, la TNT se présente comme une technologie produite avec la volonté de répondre aux attentes des utilisateurs en termes de confort visuel et sonore. Dans la perspective de l'arrêt de la diffusion hertzienne analogique, la TNT permet également d'allouer les fréquences libérées à d'autres modes de télécommunication en pleine expansion tels que la radio numérique, la télévision mobile personnelle, Internet sans fil, les télécommunications professionnelles, la téléphonie, etc.
L'OUVERTURE NUMERIQUE: DU LOCAL AU GLOBAL La télévision numérique terrestre dans les DOM : quels enjeux socio-économiques et socioculturels pour nos sociétés ultramarines ?
Lamentin (Guadeloupe), France

hal-01152892
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01152892
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01152892/document
https://hal.univ-antilles.fr/hal-01152892/file/Identites_regionales_vs_Televison_Numerique_Terrestre.pdf

Résumé : After a period of rapid development of the sites (an increase in both reared surface area and production), tropical shrimp aquaculture is currently being faced with critical problems due to economical and ecological constraints. In many countries with favourable conditions for shrimp aquaculture such as indonesia or Vietnam, sites are often badly selected and/or over-exploited. This conducts to sorne extent to decreases or collapses in the production due to the difficulty in predicting the maximum production capacity of the sites. Furthermore, it appears that production sustainability depends on many factors among which socio-economy and ecolo gy are of prime importance. The STD3 project titled « Assessment of tropical shrimp aquaculture impact on the environment in tropical countries using hydrobiology, ecology and remote sensing as helping tools for diagnosis )) was initiated in 1994, with the aim to study the sustainability of marine shrimp aquaculture in tropical areas, main! y Indonesia and Vietnam, through the following tasks: (i) improve site selection and study the impact of aquaculture on marine environments presenting a variable sensitivity to organic sewage, (ii) analyse the socio-economical aspects and profitability of the aquaculture industry and of common resources (iii) use remote sensing and geographical data bases for diagnosis and monitoring of site degradation (iv) reinforce the capacity of Asian scientists through training. Severa! aquaculture sites have been investigated in the Lampung region (South Sumatra, Indonesia), the Mekong delta (Vietnam) and on the West coast of New-Caledonia, providing a large range of typical ecosystems encountered in Asia and in the Pacifie, from coralline sites to coastal plains with mangrove and deltaic areas. The study concerned the spatial structure and seasonal influence of these ecosystems, the temporal variation during the course of the project (3 years) and the relation between the ecological structure and farm productions. Remote sensing provides a synoptic vision over large land expanses. Severa! scenes were processed for landuse mapping using conventional classification techniques. Concerning water quality assessment, a general relation for the Java sea was found between image and field data in terms of total suspended matter. Applying this relation to a new site in Sumatra has provided an initial approach to water type and, together with land use mapping, a preliminary assessment of the suitability of the area to shrimp aquaculture development. Socio-economic research has been focused on the identification ofneeds for collective action, including public policy, in the perspective of shrimp farming sustainability. The main concern is in the regulation of shrimp farming intensification and extensification at the scale of coastal ecosystemic entities in a common property resource management perspective. The common considered here is coastal water quality. Comparing the local development profiles and the institutional grounds for the design and implementation of collective management rules shows that variables such as land tenure system, farm owner socio-economic profile, social homogeneity or heterogeneity of the farmers are key factors to analyse the potential for sustainability. The defmition of water quality and the possible means to ensure its collective management are discussed. The main conclusion is that the economie incentives to farming development are strong but there is no significant difference among traditional, semi-intensive and intensive systems in terms of economie efficiency or wealth distribution. The description of the functioning of the different kinds of ecosystems make it possible to give an advice concerning the positioning of the activity inside the ecosystem, and furthermore to have a reference state in order to determine the impact of the activity on the coastal environnement. This impact can be summarized as an increase in the concentration of total suspended matt€?r, of particulate organic matter and of sulfate reducing bacterias. This organic ma~.er is either issued from rearing activities or from telluric origine, due to mangrove eradication when building the ponds. An evaluation of the relationship existing between productivity and characteristics of each ecosystem bas been conducted by correlating ecological indicators data (concentration of total suspended matter, particulate organic matter, chlorophyll, percentage of pheopigments in total pigments and cyanobacteria and sulfatereducing bacteria in water and sediments) with the average production of the farms. This comparison lead to the compilation of a scale of observed production integrating the range of these environmental parameters with shrimp production levels, bound to facilitate the positioning of shrimp farming in relation with the confmement leve! of each ecosystem. Lastly, ali geographie data originated from the various compartments of the study have been geo-referenced and loaded into a geographical information system. This allows to display any query made on spatial variables and their related statistical data, including the ir variations over the last few years and to reveal patterns and phenomena otherwise not obvious.
Le programme mis en oeuvre par la DRV (Paris, CREMA-L'Houmeau, DELIAO Brest, COP Tahiti, GIE/RA Nouvelle Calédonie), dans le cadre d'un projet européen STD3 «(Sciences et Technique au Service du Développement», en collaboration avec l'Université de Montpellier II, l'Ecole Nationale d'Agronomie de Rennes, l'ITC (Hollande), l'Institut Océanographique de Nha Trang (Vietnam), le BADC de Jepara et le BPPT de Jakarta (Indonésie), avait pour but la mise au point de méthodes permettant d'améliorer la sélection des sites ainsi que le suivi du développement et de l'impact de l'aquaculture des crevettes Péneides en milieu tropical pour éviter la surexploitation. Quatre axes de recherche ont été défmis : a) identifier la nature et quantifier les rejets de déchets issus de ce type d'aquaculture, b) définir les caractéristiques écologiques des écosystèmes susceptibles d'accueillir l'activité aquacole et suivre leur évolution sous l'influence des rejets, c) déterminer l'influence de la gestion des fermes et des ressources (aspects économiques) sur les performances de productivité, d) déterminer la capacité de la télédétection comme outil de diagnostic d'impact à l'échelle de la région, e) mener un programme de formation d'étudiants et jeunes chercheurs Vietnamiens et Indonésiens.

Droits : 1998 Ifremer
http://archimer.ifremer.fr/doc/00132/24357/22357.pdf
http://archimer.ifremer.fr/doc/00132/24357/

Éditeur(s) : HAL CCSD
Résumé : Juin 2003
Dans le contexte actuel de mondialisation, de changement climatique et de forte anthropisation de la biosphère, les Petites Antilles s'érigent en monde marginal ou encore en anti-monde. Fracturées du point de vue politique, économique, linguistique et à certains égards culturel, ces territoires insulaires du Bassin caraïbe recèlent de richesses environnementales (physiques, écosystèmiques et paysagères). Comme partout ailleurs dans le monde humanisé, la survie de ces sociétés implique le rétablissement des grands équilibres écologiques consubstantiels à une articulation efficiente entre le naturel, l'urbain et l'agricole. Compte tenu de la pression démographique, variable d'une île à l'autre, la pérennité des écosystèmes en covariance avec un développement économique profitant au plus grand nombre ne peut se concevoir à l'échelle insulaire. Il semble judicieux d'imaginer un développement à l'échelle de l'archipel basé sur la complémentarité, puisque au sein de chaque composante les diverses ressources biologiques terrestres et marines sont insuffisantes pour assurer une autosuffisance en termes de produits de premières nécessités et d'énergie. Le développement des Petites Antilles s'il doit être durable et prendre comme ossature les directives de Rio (Brésil, 1992) et de Johannesburg (Afrique du Sud, 2002), il devra s'inscrire dans une gestion administrative, scientifique, technique et agricole commune dans le cadre d'une Caraïbe fonctionnellement unifiée. A l'unité floristique, faunistique et biocénotique doivent correspondre des stratégies et donc des politiques, similaires mais diversifiées, d'utilisation des ressources abiotiques (énergie éolienne, hydroélectrique et photovoltaïque) et biotiques (écosystèmes terrestres et marins, flore, faune, sols). Malheureusement dans le présent, la compartimentation économique et politique de la Caraïbe rend ces propos profondément utopiques. Néanmoins dans le futur la survie des peuples des Petites Antilles, impliquera un développement durable signifié par des rapports équilibrés entre hommes et milieux.
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In the nowadays context of "globalization", climatic variation and great anthropization of the biosphere, the Lesser Antilles appear as a marginal world. In a political point of view, those islands offer a greatly distinct and fractured image. The same fact can also be observed in an economic, linguistic and, in a certain measure, cultural perspective. Despite of such a statement, those territories of the Caribbean basin keep economic and landscape resources whom survival depends on the re-establishment of the great ecologic structures implying a productive articulation between the natural, the urban and the agricultural. It seems pertinent to imagine a development on the level of the archipelago based upon complementarity since each constituent presents a limited number of earth and marine biologic reserves which do not guarantee an autosubsistance in energy and first nessecity productivity. A lasting development of the Lesser Antilles supposes a necessary and commun administrative, scientific, technical and agricultural management within the setting of a Caribbean functionally unified. Facing the biocenotic unity, a useful strategy, based on a similar and diversified organization in the exploitation of biophisic resources, must be erected. Such statements could be considered as utopic, regarding the situation of politic and economic division in the Caribbean nowadays. However, in the future, the survival of those insular societies will imply a lasting development lying upon an efficient relationship between Man and environment.
https://halshs.archives-ouvertes.fr/halshs-00003054

Droits : info:eu-repo/semantics/OpenAccess
halshs-00003054
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Résumé : L'agriculture actuelle est impliquée dans de multiples problématiques environnementales, sociales et économiques, aux échelles locales et globales. En agronomie, de nombreux travaux à l'échelle du champ et de l'exploitation visent aujourd'hui à concevoir des systèmes de culture et des systèmes de production en lien avec ces problématiques. En revanche, peu de travaux portent sur la conception et l'évaluation de systèmes agricoles à l'échelle du territoire, alors que cette échelle apparaît pourtant incontournable pour faire face à des enjeux de développement durable. Pour combler ce manque, nous proposons un ensemble méthodologique permettant i) de simuler les conséquences de scénarios de politiques agricoles sur les choix d'assolement des agriculteurs, décrits individuellement, en modélisant l'évolution de leurs système de production et ii) d'évaluer l'impact de ces changements d'assolements à l'échelle du territoire, à l'aide d'indicateurs qui apportent de l'information spatiale sur la contribution de l'agriculture au développement durable. L'ensemble méthodologique proposé débute par la construction d'une typologie des exploitations agricoles du territoire sur la base de la similarité de leur assolement. Parallèlement, l'adaptation d'indicateurs à l'échelle du territoire permet d'évaluer les impacts des externalités des systèmes de culture en mobilisant des procédures de changements d'échelles. Un modèle bioéconomique générique, multi-échelle, spatialement explicite, appelé MOSAICA, qui utilise la typologie et les indicateurs d'impact de l'agriculture à l'échelle régionale, est créé pour produire des mosaïques de systèmes de culture et évalue leur contribution au développement durable du territoire. Ce modèle, couplé à un itinéraire de définition de scénarios exploratoires et normatifs permet de tester l'impact de différents types de leviers agronomiques, socio-économiques, environnementaux, organisationnels et techniques sur les choix des exploitants et in fine sur la contribution de la mosaïque de systèmes de culture au développement durable du territoire. Nous avons appliqué cet ensemble méthodologique à la conception de scénarios de développement agricoles durables en Guadeloupe. Nous avons dans un premier temps développé une typologie des systèmes de production comprenant huit types distincts et relevant de processus décisionnel différents. Puis nous avons adapté à l'échelle du territoire 19 indicateurs pour l'évaluation des mosaïques de systèmes de culture. L’évaluation de la mosaïque actuelle nous a permis de repérer de faibles niveaux de contribution aux enjeux d’autonomie alimentaire et énergétique. Différents scénarios normatifs et exploratoires intégrant des leviers de changement de la mosaïque ont été testés avec MOSAICA. Les évaluations réalisées nous ont permis d'identifier que des leviers agronomiques comme le développement du maraîchage sans intrants chimiques et des leviers sociaux comme la formation de main-d'oeuvre supplémentaire permettraient d'améliorer la contribution de l’agriculture au développement durable du territoire Guadeloupéen. La modélisation mécaniste de l’évolution du territoire agricole permet d'intégrer des connaissances sur la localisation, les performances, les impacts des systèmes de culture et sur les processus décisionnels des exploitants régissant l’orientation productive et le fonctionnement des exploitations. Cette démarche permet de visualiser les changements de système de culture et leurs impacts de manière spatialement explicite, ce qui permet de générer des connaissances sur les leviers susceptibles de faire évoluer positivement l'agriculture du territoire. La démarche et les outils mis en oeuvre sont donc particulièrement utiles pour l'aide à la décision publique pour améliorer la durabilité de l'agriculture dans son ensemble.
Current agricultural systems are responsible for many different environmental, social and economic issues at both local and global scales. Agricultural sciences have contributed to the design of several methods at the farm and field scale in order to prototype cropping systems and farming systems to address these issues. However, few methods have been designed at the regional scale, while this scale seems to be essential in order to address these issues. In order to fill this gap, we here propose a new methodological framework for i) simulating the consequences of policy changes on farmer's cropping plan, described individually, by modeling the evolution of farming systems and to ii) assess the impacts of cropping system changes at the regional scale, with a set of indicators that generate spatially explicit information on the contribution of agriculture to sustainable development. The methodological framework starts with the design of a farm typology over the territory based on the similarity of farmer's crop acreages. In parallel, a set of indicators is adapted to the landscape scale in order to assess the impacts of cropping system externalities by integrating a set of scale change procedures. A generic, multi-scale, spatially explicit bioeconomic model called MOSAICA, which uses the farm typology and the indicators, is created for generating cropping system mosaics and assessing their contribution to sustainable development. This model coupled to a scenario approach composed of exploratory and normative scenarios can simulate the impact of several types of agronomic, socio-economic, environmental, organizational and technical levers of change on the farmer's choices in terms of cropping systems and in fine the impacts of new cropping system mosaics on the contribution to sustainable development of territories. We applied this methodological framework for building scenarios of sustainable agricultural development in Guadeloupe. We first developed a typology of farming systems encompassing eight types of farming systems that revealed several different farmer's decision processes. Then, we developed 19 indicators to assess cropping system mosaics. The assessment of the current cropping system mosaic showed low levels of response of the current mosaic to economic and social issues especially the food and energy self-sufficiency. Different normative and exploratory scenarios integrating levers of change have been simulated with MOSAICA. The assessment of cropping system mosaics from these scenarios highlighted the positive effect of agronomic levers of change such as organic crop-gardening and social levers such as the vocational training of supplementary workforce for improving the contribution of agriculture to sustainable development of the guadeloupean territory. The mechanistic modeling of the agricultural territory allows us to integrate a wide range of knowledge on the location of cropping systems, their levels of performance , their impacts and the decision process of farmer's that drive the farming system characteristics and the farm functioning. This methodological framework helps visualize the cropping system changes at the regional scale and their associated impacts at the landscape scale which is helpful in order to produce knowledge on the levers of change that can improve the response of local agriculture to local and global issues. The framework and tools designed are particularly useful for decision-aid on the future levels of contribution of agriculture to sustainable development.

http://www.theses.fr/2015AGUY0823/document

Éditeur(s) : HAL CCSD American Society for Microbiology
Résumé : International audience
Human leishmaniasis are widely spread diseases with different clinical forms caused by about 20 species within the Leishmania genus. Leishmania species identification is relevant for therapeutic management and prognosis, especially for cutaneous and muco-cutaneous forms. Several methods are available to identify Leishmania species from culture, but they have not been standardized for the majority of the currently described species, with the exception of MultiLocus Enzyme Electrophoresis. Moreover, these techniques are expensive, time-consuming and not available in all laboratories. Within the last decade, mass spectrometry (MS) has been adapted for microorganism identification, including Leishmania However, no commercial reference mass spectral database is available. In this study, a reference mass spectral library (MSL) for Leishmania isolates, accessible through a free web-based application (mass spectral identification, MSI), was constructed and tested. It includes mass spectral data for 33 different Leishmania species, including species that infect humans, animals and phlebotomine vectors. Four laboratories on two continents evaluated MSI performance using 268 samples of which 231 were Leishmania strains. All Leishmania strains, but one, were correctly identified at least at the complex level. A risk of species misidentification within the L. donovani, L. guyanensis and L. braziliensis complexes was observed, as already reported with other techniques. The tested application was reliable, with identification results comparable to those obtained with reference methods, but with a more favorable cost-efficiency ratio. This free online identification system relies on a scalable database and can be implemented directly in the user's computers.
ISSN: 0095-1137

hal-01571305
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01571305
DOI : 10.1128/JCM.00845-17
PUBMED : 28724559